Il lui fallait donc une église assez grande pour accueillir un millier de personnes au moins. Le conseil municipal délibère pour établir un plan de financement pour l’édification de cette église : vente de pins d’éclaircissage, vente de biens communaux et emprunt. La somme nécessaire étant atteinte (120 000 francs environ, inclus l’achat du terrain), les travaux sont confiés en 1889 à l’architecte Louis Labbée, disciple de l’architecte bordelais Jean-Louis Abadie.
Louis Labbée propose aux élus un projet de style roman poitevin très largement inspiré de l’église de Sainte-Marie-de-la-Bastide à Bordeaux, avec clocher et clochetons couverts de tuiles en écailles, un style unique parmi les église landaises. La voute en bois, en forme de coque de bateau renversée, et le porche intégré au clocher permettent de compenser le poids de la toiture. Autre particularité morcenaise et pour être en cohérence avec le système urbain déjà existant, le chevet de l’église est délibérément orienté à l’ouest par l’architecte, l’église se trouvant ainsi mise en perspective de l’axe est-ouest qui traverse la place du centre-bourg.
Elle est consacrée à Saint-Vincent-de-Paul en 1896. Le beffroi est doté d’une cloche en 1895 à laquelle s’ajouteront deux autres cloches en 1954 et 1988. Un orgue de belle facture lui est adjoint en 1979.
